離子色譜儀主要用于環(huán)境樣品的分析，包括地面水、飲用水、雨水、生活污水和工業(yè)廢水、酸沉降物和大氣顆粒物等樣品中的陰、陽離子，與微電子工業(yè)有關(guān)的水和試劑中痕量雜質(zhì)的分析。

另外在食品、衛(wèi)生、石油化工、水及地質(zhì)等領(lǐng)域離子色譜儀也有廣泛的應(yīng)用。
經(jīng)常檢測的常見離子：
陰離子：F-, Cl-, Br-, NO2-, PO43-, NO3-, SO42-，甲酸，乙酸，草酸等。
陽離子：Li+, Na+, NH4+, K+, Ca2+, Mg2+, Cu2+, Zn2+, Fe2+, Fe3+等。
離子色譜儀分離測定常見的陰離子是它的專長，一針樣品打進去，約在20分鐘以內(nèi)就可得到7個常見離子的測定結(jié)果，這是其他分析手段所無法達到的，關(guān)于陽離子的測定離子色譜法與AAS和ICP法相比則未顯示出*性。
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